Lethal Thunder ofrece la fórmula clásica de disparo con desplazamiento cooperativo a dos jugadores, con un sistema de potencia de fuego que crece mientras se presiona el botón de disparo con rapidez y se drena si el jugador deja de hacerlo, lo que exige mantener un ritmo constante de pulsaciones. Su rasgo más particular es el sistema de finales múltiples: dejar escapar a distintos jefes en vez de derrotarlos cambia el desenlace de la historia, hasta cuatro variantes posibles.
Corrió sobre la placa Irem M92, la misma familia de hardware que sostuvo otros shooters de la compañía en ese período, y es recordado dentro del circuito de fans por esa combinación poco común de mecánica de disparo activo y narrativa ramificada según el desempeño del jugador.

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